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GenBank数据库,什么是GenBank数据库?

时间:2025-01-04

分类:数据库

编辑:admin

什么是GenBank数据库?GenBank数据库,全称为美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInfor...

什么是GenBank数据库?

GenBank数据库,全称为美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的核苷酸序列数据库,是世界上最大的公共核苷酸序列数据库之一。它由美国国立卫生研讨院(National Institutes of Health,NIH)部属的NCBI办理,是一个敞开获取的数据库,旨在搜集和供给全球范围内的生物分子序列数据。

GenBank数据库的前史与重要性

GenBank成立于1982年,自那时起,它一直是生物信息学范畴的重要资源。跟着基因组学和生物信息学的开展,GenBank的重要性日益凸显。它不仅为科研人员供给了很多的序列数据,并且促进了全球范围内的生物多样性研讨和生物技术开展。

GenBank数据库的内容

GenBank数据库包含了来自全球各地数百万条DNA和RNA序列数据,涵盖了多种生物体的基因组、转录组和蛋白质组数据。这些数据来历于测序工作者提交的序列、测序中心提交的很多EST序列和其它测序数据,以及与其它数据组织协作交流数据而来。

GenBank数据库的数据按以下类别进行分类:

基因组序列(Genome Sequences)

转录组序列(Transcript Sequences)

蛋白质组序列(Protein Sequences)

表达序列符号(Expressed Sequence Tags,ESTs)

序列符号位点(Sequence Tagged Sites,STSs)

基因组概览序列(Genome Survey Sequences,GSSs)

GenBank数据库的运用方法

经过NCBI的Entrez数据库查询体系进行查询。

运用BLAST程序对GenBank数据库进行不知道序列的同源性查找。

从NCBI的FTP服务器上下载完好的数据库或新数据。

GenBank数据库的优势

GenBank数据库具有以下优势:

数据量大:GenBank数据库包含了来自全球各地的数百万条序列数据,为科研人员供给了丰厚的数据资源。

数据更新快:GenBank数据库每天都会更新,文字供词了数据的时效性。

数据质量高:GenBank数据库对提交的数据进行严厉的审阅,文字供词了数据的质量。

数据同享:GenBank数据库是一个敞开获取的数据库,用户能够免费获取和运用数据。

GenBank数据库的使用

基因功用研讨:经过比较序列相似性,能够揣度不知道基因的功用。

基因组学研讨:GenBank数据库为基因组学研讨供给了重要的数据支撑。

生物信息学研讨:GenBank数据库是生物信息学研讨的重要数据来历。

药物研制:GenBank数据库为药物研制供给了重要的靶点信息。

GenBank数据库作为世界上最大的公共核苷酸序列数据库之一,为全球科研人员供给了丰厚的生物分子序列数据。它的敞开获取、数据量大、更新快、质量高级特色,使其成为生物科学范畴不可或缺的重要资源。

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