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ncbi数据库,深化了解NCBI数据库——生物信息学研讨的宝库

时间:2025-01-14

分类:数据库

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简介NCBI成立于1988年,是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分,坐落马里兰州的贝塞斯达。它由多学科的研讨小组组成,包含核算机科学家、分子生物学家、数学家...

简介NCBI成立于1988年,是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分,坐落马里兰州的贝塞斯达。它由多学科的研讨小组组成,包含核算机科学家、分子生物学家、数学家、生物化学家、实验物理学家和结构生物学家,专心于核算分子生物学的根底和应用研讨。

首要数据库和东西1. GenBank:一个揭露的核酸序列数据库,首要存储DNA和RNA序列。2. PubMed:一个医学文献数据库,供给广泛的生物医学文献检索。3. BLAST(Basic Local Alignment Search Tool):用于比较生物序列的东西,能够协助快速找到类似的基因或蛋白。4. Entrez:一个集成的数据库检索系统,包含Gene、Protein、Nucleotide、OMIM、Taxonomy等子数据库。5. OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man):供给人类遗传病信息的数据库。6. GEO(Gene Expression Omnibus):存储高通量基因表达数据的数据库。

实例例如,假如你想查找人类GSR基因的信息,能够经过以下过程:1. 翻开NCBI官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。2. 在下拉列表中挑选“Gene”。3. 输入“GSR”进行查找。4. 在查找成果中,你能够检查GSR基因的具体信息,包含基因组方位、文献引证等。

经过以上信息,你能够更好地了解和运用NCBI数据库,进行生物医学和基因组学的研讨。

深化了解NCBI数据库——生物信息学研讨的宝库

跟着生物科学技术的飞速发展,生物信息学作为一门新式的交叉学科,在基因组学、蛋白质组学、代谢组学等范畴发挥着越来越重要的效果。NCBI(National Center for Biotechnology Information)作为全球抢先的生物信息学数据库,为科研工作者供给了丰厚的生物信息资源。本文将具体介绍NCBI数据库的概略、首要功能以及运用方法,协助读者更好地运用这一名贵的科研资源。

NCBI是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)部属的国家生物技术信息中心,成立于1988年。NCBI致力于搜集、收拾、剖析和传达生物信息学数据,为全球科研工作者供给快捷的科研服务。NCBI数据库涵盖了基因组学、蛋白质组学、遗传学、生物化学、医学等多个范畴,是生物信息学研讨的重要根底。

NCBI数据库具有以下首要功能:

基因序列数据库:包含GenBank、RefSeq、GEO等,供给全球范围内的基因序列信息。

生物医学文献数据库:PubMed,收录了很多的生物医学文献,包含期刊文章、会议论文、书本等。

蛋白质结构数据库:Protein Data Bank(PDB),供给蛋白质的三维结构信息。

遗传学数据库:OMIM、dbSNP等,供给人类遗传病、基因变异等信息。

生物信息学东西:BLAST、Clustal Omega等,用于序列比对、结构猜测、系统发育剖析等。

以下是运用NCBI数据库的根本过程:

拜访NCBI官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。

挑选所需数据库:在主页上方导航栏中,挑选相应的数据库,如GenBank、PubMed等。

进行查找:在查找框中输入关键词,如基因称号、蛋白质称号等,点击查找按钮。

阅读成果:依据查找成果,阅读相关数据,如基因序列、文献摘要、蛋白质结构等。

下载数据:依据需要,下载所需数据,如基因序列、文献全文、蛋白质结构等。

NCBI数据库具有以下优势:

数据丰厚:NCBI数据库涵盖了全球范围内的生物信息学数据,为科研工作者供给了丰厚的资源。

更新及时:NCBI数据库实时更新,保证科研工作者获取最新的生物信息。

功能强大:NCBI数据库供给了多种生物信息学东西,便利科研工作者进行数据剖析和研讨。

操作简洁:NCBI数据库界面友爱,操作简略,易于上手。

NCBI数据库作为全球抢先的生物信息学数据库,为科研工作者供给了丰厚的生物信息资源。了解和把握NCBI数据库的运用方法,有助于科研工作者更好地展开生物信息学研讨。本文对NCBI数据库的概略、首要功能以及运用方法进行了具体介绍,期望对读者有所协助。

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