circrna数据库,circrnadb数据库

关于circRNA数据库，以下是几个常用的数据库及其功用介绍：

1. circBase 简介：circBase是一个综合性数据库，搜集了多个物种的环状RNA信息，包含人、小鼠、秀美线虫、黑腹果蝇、矛尾鱼和腔棘鱼等。该数据库供给了根据序列的查找、经过标识符、基因描绘、基因组方位等查找数据库的功用，并支撑多种形式的表格导出和基因组序列的FASTA文件导出。

2. CIRCpedia 简介：CIRCpedia v2是一个供给circRNA的注释、表达、保存性和差异表达信息的数据库，涵盖了六个不同物种的185个RNAseq数据集。用户能够经过查找、阅读、下载和可视化东西查询和剖析circRNA的相关信息。

3. circBank 简介：circBank是一个搜集circRNA信息的综合性数据库，由吉赛生物和多伦多大学联合构建，旨在为研讨者供给快捷的circRNA研讨东西，加快circRNA根底和使用研讨进展。

4. CircRNADisease 简介：CircRNADisease数据库根据800多篇报导circRNA与疾病相关的文献，搜集了330个circRNA与48种疾病之间的354对彼此联络，其间肿瘤相关疾病占54%，心血管和脑血管相关疾病占27%。

5. TSCD和CSCD 简介：这些数据库涵盖了circRNA的特征、功用、彼此作用、预后价值等方面的信息，能够协助circRNA研讨者进行判定、剖析、验证和使用。

6. deepBase 简介：deepBase数据库包含了大约15万的circRNA基因（人、鼠、果蝇、线虫等），构建了最全面的circRNA的表达图谱。

7. circRNABase 简介：circRNABase整合已宣布的circRNA数据，构建了miRNA与circRNA以及circRNA与RNA结合蛋白（RBP）的互作网络。

这些数据库为circRNA的研讨供给了丰厚的资源和东西，协助研讨者从多个视点进行circRNA的剖析和研讨。假如你需求更具体的信息，能够拜访上述数据库的官方网站。